選擇好的防水透氣膜之后，就要開始防水透氣膜施工問題。在施工過程中盡量避免在防水透氣膜上穿透和開口，盡量保證防水透氣膜的完整性。如果必須開口或穿透時，穿透和開口處用丁基膠帶密封。

由于防水透氣膜無明顯阻燃效果，應盡量避免幕墻工程連接件使用焊接，將明火作業(含焊接)工序安排在防水透氣膜施工前進行，嚴禁在防水透氣膜附近進行明火作業(含電焊施工)。

在鋪設防水透氣膜時，可根據實際情況，選擇鋪設方式，將防水透氣膜與保溫棉用巖棉釘固定，固定處的巖棉釘用丁基膠帶密封，密封處面積大小以丁基膠帶將釘頭完全覆蓋為標準。

在施工前清理角碼上的灰塵及油污，確保角碼清潔，以保證角碼與防水透氣膜的粘結效果。角碼穿過防水透氣膜處應盡量保證防水透氣膜的完整，防水透氣膜曲線泛水將角碼一周與防水透氣膜完全密封。密封處與角碼粘結不小于2cm。

將防水透氣膜與窗框及門框搭接，應用防水透氣膜直線泛水密封，轉角處應用防水透氣膜曲線泛水密封。密封處與窗框及門框粘接寬度不小于2cm，轉角處粘結寬度不小于10cm。安裝順序為:門窗框下部→門窗框下部轉角→門窗框的側框→門窗框的上部轉角→門窗框的上部→密封。

在屋面施工時，防水透氣膜的鋪設應沿著屋面的順水方向，搭接長度為10cm，屋面的高強度鋁合金支架穿過防水透氣膜時，鋁合金支架與防水透氣膜交接處，用丁基膠條環繞一圈進行密封。此外，防水透氣膜不宜長期暴露在紫外線下，外飾面工程應盡快完成。